新冠病毒在2020年3月12日大爆发，阿根廷政府在世卫组织 (OMS) 将之定调为大流行 (pandemia) 的隔日就签署行政命令 (DNU) 宣布公卫紧急事态，并为期一年。如今期间已至，政府决定将紧急事态再延至2021年12月31日，授予行政机关采取特殊权限应急、以保护国人健康 (decreto 167/2021)。
应急措施中包括，卫生部可提出建议限制疫区、或高风险地区的往来交通，减少疫区的国际航运的来回班次甚至暂停，其中包括空中、海上及陆地运输。
需遵守「强制隔离」的对象，包括：

依国家卫生部公告的定义，通报之疑似病例 (“casos sospechosos”)，都必须隔离等待诊断，直到明确的结果出炉，或确定是阴性。
依国家卫生部公告的定义确诊之病例 (“casos confirmados”)，必须遵守10天隔离防疫：自出现症症的那天开始算起，无症状者则是从确诊的那天开始算起。
循国家卫生部公告的建议，所有与Covid-19确诊患者近身接触 (“contactos estrechos”) 的人员，也应遵守14天的隔离检疫，若符合卫生部建议亦可以缩短为10天。
所有自境外返国者，除非该部或移民局认可之特例情况，都须遵从卫生部要求之防疫条件。

入境者应如实呈报行程、告知官方在阿根廷的住址，并接受非侵入性的身体检查避免传染风险，以及所有的防疫措施。
同时也得提供出发前72小时有效的核酸 (PCR) 阴性证明，卫生部将可决定是否升级上述防疫措施，或是加以修订。

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